Omitir diretório/subdomínio do site

Boa noite pessoal!

Eu instalei meu site em um diretório e não na pasta raíz, pois tenho outros serviços e iria facilitar a organização.

Atualmente a url está como um subdomínio: site.dominio.com.br

Gostaria de saber se existe algum modo, usando estrutura de subdomínio ou de diretório (dominio.com.br/site) de omitir a verdadeira localização do site. Por exemplo, o site continua na pasta “site”, mas no link é mostrado apenas o domínio puro, dominio.com.br

Notem que não se trata de redirecionamento, pois isso eu já faço. Gostaria de poder omitir mesmo o diretório da instalação.

Caso não seja possível, o que é melhor: usar site.dominio.com.br ou dominio.com.br/site ?

Obrigado!