Isso, seria essa versão.
Quando você tiver ela disponível irá aparecer uma nova opção no menu chama editor, ai basta acessa-la e procurar o arquivo index.php.
Você configurou corretamente a sua API Key na parte especifica do “Advanced Options” do plugin do Disqus?
Ao meu ver o problema certamente está nessa integração e não em nada relacionado a sua instalação do WordPress.
Primeiramente esse tipo de alteração vai necessitar que você possua a versão paga do WordPress.com.
Segundo, provavelmente você terá que alterar o CSS sim, além é claro de mudar o arquivo index.php do tema para reposicionar esse conteúdo.
Basta alterar a opção de visibilidade no momento de criação do conteúdo para “privado” e então verificar no próprio tema se o usuário está logado com a função is_user_logged_in()
Existem outros meios, porém esse na minha opinião é o que melhor lhe da controle sobre como e quando cada conteúdo será exibido.
Por exemplo: eu exibo os conteúdos privados juntos dos demais, porém só para usuários logados os links aparecem.
