Oi amigo,
Não sei se você ainda está com esse problema, mas se estiver, dá uma olhada no meu post no endereço abaixo. Foi o que resolveu para mim e funciona perfeitamente.
Caso precise de mais uma força, me informe ok?
Segue o post com a solução do problema:
http://www.mimetismo.com.br/consultoria/paginacao-no-wordpress-com-wp_pagenavi-e-query_posts/
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