Vou ver se pode ser isso, mas no meu caso estou achando que é alguma coisa no meu servidor mesmo que não está liberando o wordpress a criar novas pastas,
Abraços!
Estou com o mesmo problema, no meu caso já tentei inclusive mudar as permissões das pastas, não adianta.
Não atualiza plugins, não atualiza temas e nem atualiza do WP.
O que mais me intriga é que quando tento atualizar algum plugin ele depois cria um arquivo .maintenance que deixa o meu site fora do ar.
Espero que alguém tenha uma resposta.