WP_Query ou query_posts?

É bem simples.

O query_posts funciona assim:

function query_posts($query) {
    $GLOBALS['wp_query'] = new WP_Query();
    return $GLOBALS['wp_query']->query($query);
}

Desta forma a finalidade do query_posts é alterar a query nativa do WP (a variável global wp_query) apenas.
Criar vários loops com ela pode acabar criando também problemas… Principalmente com paginação ou outros query_posts na mesma página que irão herdar o comportamento.

Já o WP_Query cria uma nova query e nesse caso é indicado para criar múltiplos loops em uma página já que não vai usar a query nativa ou influenciar com as outras querys.

Você não falou, mas vou citar outros casos xD

Também é possível usar o filtro pre_get_posts para alterar o wp_query no lugar do query_posts.
O que é mais indicado para este caso.

Para criar loops secundários você pode usar o get_posts que usa o WP_Query.
E também existe o get_pages que funciona similar ao get_posts entretanto ele faz uma consulta direta no banco sem usar o WP_Query.

Você não entendeu cara.
O query_posts usa a query nativa. Mas recomendo usar o filtro pre_get_posts para fazer esse tipo de alteração.

Se tiver vários query_posts em uma página com certeza vai causar lentidão.