Woocommerce Mostara categorias

Voce precisa usar o filtro woocommerce_product_subcategories_args

add_filter( 'woocommerce_product_subcategories_args', 'any_function', -10 )
function any_function( $args ){
 $args['parent'] = id da categoria pai;
return $args;
}

Isso irá mostrar apenas as subcategorias que estão diretamente ligadas a categoria pai.