URLS amigáveis em conjunto com um Sistema Proprietário

Olá,

Sou novo por aqui! Trabalhei como desenvolvedor gráfico, impressão, algum tempo e mantenho um projeto paralelo, em maturação, baseado no desenvolvimento ou customização de templates. Venho diretamente do “Joomla!”, usuário desde o mambo estou tendo dificuldade em configurar as URLs amigáveis e ainda carregar um sistema proprietário que fica em outra pasta.

Tentei com iFrame e depois com o modal (LightBox Plus) tentando carregar as páginas, sem sucesso quando os links permanentes estão diferentes do padrão.

O WP está instalado na raíz e quando habilito os links pemanentes para “../%postname%/” o .htaccess não permite carregar os formulários desta pasta, já que há redirecionamento, inclusive das variáveis imagino, dando um erro de página inexistente.

Tentei mudar o local do WP, mantendo hierarquicamente ao lado da pasta do sistema proprietário, mas como é necessário o index.php e o .htaccess na raíz o problema continuou. Busquei solução tentando evitar que houvesse redirecionamento apenas desta pasta, por meio do .htaccess, mas não achei literatura com solução.Seria lógico apenas evitar o Rewrite filtrando a pasta. Isso é possível?

Achei o CMS prático e estou mesmo me aprofundando. Atendendo a pedidos de amigos que acabaram se tornando clientes, não tive como evitar – Eles querem o WordPress, no entanto é muito diferente no que diz respeito ao núcleo e estruturação. Estou apanhando!

Espero ter escolhido a Seção correta para iniciar! Me orientem se falhei.

Alguma dica ou norte para eu mergular de cabeça?

[]s,
Mario Ximenes