Produto variável com problema de estoque

Olá, tudo bem?

Poderia testar com o Tema Padrão do WooCommerce?
Fiz um teste aqui numa loja de testes que eu tenho e esse comportamento não ocorre. Creio que pode ser algum problema do seu Tema.

Teste com estoque 0 no produto pai e estoque 10 na variação e mesmo assim só apareceu a notificação de fora de estoque ao escolher a variação sem estoque.

Se com o tema padrão isso ocorrer, verifique também se não é algum plugin causando esse problema: desative todos (menos o Woo) e vá ativando novamente até o problema ocorrer.

Abraços