boa tarde @gtaundercover,
bem, você postou em Gerenciamento de Conteúdo, mas isso tem muito jeito de ser questão relacionada a configuração do woocommerce. tipo em algum lugar das configurações do woocommerce ou do tema (caso seja um template com o woocommerce integrado) há essa questão da quantidade de variações. por isso que com menos de 20 variações o problema não ocorre. ou essa limitação pode ser do próprio woocommerce, não sou especialista nesse plugin.
por isso lhe escrevo, pois você deveria postar em Plugins, onde será mais fácil alguém com conhecimento woocommerce lhe dar alguma ajuda. além disso, deveria buscar ajuda no suporte oficial do woocommerce. talvez já haja essa resposta lá ou você pode perguntar – se for o caso, usando o google translate para o inglês
https://woocommerce.com/contact-us/
pesquisando rapidamente no Google com “woocommerce limit variantions”, vi 2 resultados abaixo linkados que parecem muito com seu caso
https://wordpress.org/support/topic/woocommerce-variations-limits-to-30/
http://ideas.woocommerce.com/forums/133476-woocommerce/suggestions/2915157-increase-max-of-variations
o segundo link, inclusive, aponta que o limite do woocommerce são 50 variações (será que o problema não é com o seu tema? ou com a necessidade de atualizar tema e woocommerce?). e aponta que a solução para isso está na variável WC_MAX_LINKED_VARIATIONS presentes no arquivo wp-config.php.
ou seja, já tem um material aí que talvez lhe ajude a solucionar o caso.
abraços e boa sorte!