Malware apagou header.php de todos os sites

Pessoal,

Algum malware invadiu 1 site meu (não sei se foi por causa de plugin ou o que) e saiu percorrendo todos os meus diretórios apagando todos os arquivos header.php (Até o momento notei apenas esse) dos meus temas.
Estou fazendo de tudo para tentar restaurar esses arquivos, porém meu medo maior é isso acontecer novamente, alguém me ajuda?

Att.